STM32큐브프로그래머는 윈도우(Windows), 리눅스(Linux), MacOS 운영 체제에서 실행이 가능하여 다양한 파일 형식으로 STM32 마이크로컨트롤러의 온칩 플래시/RAM이나 외부 메모리를 프로그래밍할 수 있다. 추가 기능에는 전체 메모리 삭제, 부분 삭제 기능과 마이크로컨트롤러 옵션 바이트 프로그래밍 등이 있다. 또한 사용자는 생산 인증 및 IP 보호를 실행하는 보안 프로그래밍(보안 펌웨어 인스톨/업데이트)을 위해 암호화된 파일을 생성할 수 있다.
이 보편적인 툴을 사용해 디바이스의 SWD(Single-Wire Debug)나 JTAG 디버깅 포트, 또는 부트로더 포트(UART, USB 등)를 통해 STM32 마이크로컨트롤러를 프로그래밍할 수 있다. STM32큐브프로그래머는 ST 비주얼 프로그래머와 디퓨즈 디바이스 펌웨어 업데이트 툴, 플래시 로더, ST-링크유틸리티의 각각의 기능을 STM32큐브 에코시스템으로 가져와 쓸 수 있다.
ST는 마이크로로컨트롤러 I2C 및 CAN 포트를 통한 프로그래밍 액세스 기능을 추가해 STM32큐브프로그래머 기능을 확대할 예정이다.
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